Die Sachgruppe „Nachlässe“ enthält ca. 40 Nachlässe (Teil-Splitternachlass) deutschsprachiger Altertumsforscher (Klassische Archäologe, Epigraphik, Althistoriker, Sekretäre des Instituts). Die Nachlässe gehen über 1944 hinaus.  

Die Sachgruppe VII „Handzeichnungen“ enthält die Sammlung von Stichen, Handzeichnungen, Plänen und Skizzen von 1829 bis etwa 1915. Sie geben antike Kunst- und Gebrauchsgegenstände, Inschriften, Malereien, topographische Befunde und Bauwerke wieder, die bei neuen Ausgrabungen ans Licht kamen bzw. Gegenstand der wissenschaftlichen Diskussion waren. Die Sammlung wurde bewusst als wissenschaftlicher Handapparat aufgebaut und stellte vor allem vor der Einführung der Fotografie ein wichtiges Arbeitsinstrument dar.

In dem seit der Wiedereröffnung 1953 gewachsenen „Architektenarchiv" oder „Wissenschaftsarchiv“ befinden sich die zeichnerische Dokumentation aus den Feldforschungsprojekten der Römischen Abteilung. Sehr wichtig und umfangreich sind die Archivalien zu den Ausgrabungen in Selinunte, in Metaponto und Nordafricka.

Sowohl zu den Handzeichnungen des 19. Jahrhunderts als auch zum sog. Architektenarchiv liegen detaillierte Verzeichnisse vor. Die Sammlung der Handzeichnungen und ein Teil des Architektearchivs wurden mit Unterstützung der DFG digitalisiert und stehen jetzt online zur Verfügung (siehe unten und die Projektseite). Die Konsultation erfolgt über die Bild-und Objektdatenbank iDAI.objects/Arachne. 

Weitere Bestände sind die Gruppe Jubiläum, in der befinden sich Festschriften, Gratulationen zu den Jubiläen des Instituts und die Gruppe Bibliothek, die Kataloge aus den 19en Jahrundert, Besucherregister seit 1892 und Verzeichnisse der Erwerbungen enthält. 

Darüber hinaus umfasst das Archiv die Altregistratur, das  Verwaltungsschriftgut und Allgemeine Korrespondenzen (z.B Schriftwechsel von ehemaliger Direktoren) aus den Jahren ab 1953.

La collezione Handzeichnungen contiene l´ingente raccolta di disegni, piante e schizzi dal 1829 fino al 1915 circa, raffiguranti manufatti antichi, sculture, pitture, oggetti di uso quotidiano, iscrizioni, dipinti, elementi topografici ed edifici venuti alla luce durante nuovi scavi o oggetto di discussione scientifica. La collezione fu raccolta per le pubblicazioni dell´Istituto e come opera di consultazione scientifica e strumento di lavoro, prima dell´introduzione della fotografia. Il c.d. Architektenarchiv o archivio scientifico contiene la documentazione grafica dei progetti di ricerca del dipartimento di Roma dopo la sua riapertura nel 1953. Particolarmente importanti sono gli archivi deglia scavi di Selinunte, di Metaponto e del Nord Africa. La collezione di disegni e parte dell'archivio degli architetti sono stati digitalizzati con il sostegno della DFG e sono ora disponibili online (vedi sotto e la pagina del progetto). La consultazione avviene tramite il database di immagini e oggetti iDAI.objects/Arachne. Per questi materiali sono disponibili gli inventari dei fondi digitalizzati (vedi sotto).

Tra gli altri fondi sono degni di nota il fondo Jubiläum che contiene le pubblicazioni commemorative e gli auguri per gli anniversari dell'Istituto e il gruppo Biblioteca che raccoglie i cataloghi del XIX secolo, i registri dei visitatori dal 1892 e gli elenchi di acquisizione della biblioteca.

Infine si conserva un archivio di deposito l´Altregistratur che comprende i documenti amministrativi e la corrispondenza generale (come quella degli ex direttori) dal 1953 in poi.